Responsable: Laetitia Fouillen
L’activité Lipidome fédère les outils et les savoir-faire pour l’analyse (identification, caractérisation, quantification) des lipides dans leur grande diversité. Il est dédié à l’étude de nombreux organismes, allant des plantes, aux animaux en passant par les levures
La plateforme permet d’obtenir l’identification, la caractérisation ou la quantification (absolue ou relative) de divers lipides :
– Quantification par densitomètrie des classes de lipides
– Identification et quantification d’acides gras (de longue chaines, hydroxylé…), de waxes, de composés de la cutine et de la subérine
– Quantification relative des espèces moléculaires de phospholipides (PA, PC, PE, PG, PS, PI and PIPx), lipides neutres (TAG, DAG, steryl ester…), des sphingolipides de plantes (Cer, h-Cer, GlcCer, h-GlcCer et GIPC A&B)
– Régiolocalisation pour les espèces moléculaires de TAG
– Quantification des Alkyl HydroxyCinnamates (alkyl ferulate, alkyl coumarate et alkyl caffeate)
Les extractions et analyses peuvent être adaptées aux matériels biologiques utilisés.
Equipements Analytiques
Pour nos analyses de lipides, nous utilisons différentes technologies: TLC, GC-FID, GC-MS et LC-MS. Les équipements analytiques peuvent être en mis à disposition après une formation spécifique
- 2 systèmes GC-FID (Agilent)
- 2 systèmes GC-MS (Agilent)
- LC-Qtrap-MS
- une chaine HPTLC constitué d’un autosamplers (Camag Linomat V), d’une chambre automatique de migration (ADC2, Camag) et un scanner UV-visible TLC (Camag Scanner 3)
Sélection d’article
- Fougère, L., Moreau, H., Mirande-Bret, C., Fouillen, L.* and Boutté, Y.* (2025). PhosphoLIMBO: An Easy and Efficient Protocol to Separate and Analyze Phospholipids by HPTLC From Plant Material. Bio-protocol 15(17): e5434. 10.21769/BioProtoc.5434.
- Genva, M.; Fougère, L.; Bahammou, D.; Mongrand, S.; Boutté, Y.; Fouillen, L. A Global LC–MS2-Based Methodology to Identify and Quantify Anionic Phospholipids in Plant Samples. The Plant Journal 2024, 117 (3), 956–971. https://doi.org/10.1111/tpj.16525.
- Gan Sha, Peng Sun, Xiaojing Kong, Xinyu Han, Qiping Sun, Laetitia Fouillen, Juan Zhao, Yun Li, Lei Yang, Yin Wang, Qiuwen Gong, Yaru Zhou, Wenqing Zhou, Rashmi Jain, Jie Gao, Renliang Huang, Xiaoyang Chen, Lu Zheng, Wanying Zhang, Ziting Qin, Qi Zhou, Qingdong Zeng, Kabin Xie, Jiandi Xu, Tsan-Yu Chiu, Liang Guo, Jenny C. Mortimer, Yohann Boutté, Qiang Li, Zhensheng Kang, Pamela C. Ronald and Guotian Li (2023). Genome editing of a rice CDP-DAG synthase confers multipathogen resistance. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-023-06205-2.
- M. B. F. Steentjes, A. L. Herrera Valderrama, L. Fouillen, D. Bahammou, T. Leisen, I. Albert, T. Nurnberger, M. Hahn, S. Mongrand, O. E. Scholten and J. A. L. van Kan (2022). Cytotoxic activity of Nep1-like proteins on monocots. New Phytologist https://doi.org/10.1111/nph.18146.
- Garot E., Dussert S., Domergue F., Joet T., Fock-Bastide I., Combes M. C. and Lashermes P. (2021). Multi-Approach Analysis Reveals Local Adaptation in a Widespread Forest Tree of Reunion Island.. Plant Cell Physiol https://doi.org/10.1093/pcp/pcaa160