Responsable: Laetitia Fouillen
L’activité Lipidome fédère les outils et les savoir-faire pour l’analyse (identification, caractérisation, quantification) des lipides dans leur grande diversité. Il est dédié à l’étude de nombreux organismes, allant des plantes, aux animaux en passant par les levures
La plateforme permet d’obtenir l’identification, la caractérisation ou la quantification (absolue ou relative) de divers lipides :
– Quantification par densitomètrie des classes de lipides
– Identification et quantification d’acides gras (de longue chaines, hydroxylé…), de waxes, de composés de la cutine et de la subérine
– Quantification relative des espèces moléculaires de phospholipides (PA, PC, PE, PG, PS, PI and PIPx), lipides neutres (TAG, DAG, steryl ester…), des sphingolipides de plantes (Cer, h-Cer, GlcCer, h-GlcCer et GIPC A&B)
– Régiolocalisation pour les espèces moléculaires de TAG
– Quantification des Alkyl HydroxyCinnamates (alkyl ferulate, alkyl coumarate et alkyl caffeate)
Les extractions et analyses peuvent être adaptées aux matériels biologiques utilisés.
Equipements Analytiques
Pour nos analyses de lipides, nous utilisons différentes technologies: TLC, GC-FID, GC-MS et LC-MS. Les équipements analytiques peuvent être en mis à disposition après une formation spécifique
- 2 systèmes GC-FID (Agilent)
- 2 systèmes GC-MS (Agilent)
- LC-Qtrap-MS
- une chaine HPTLC constitué d’un autosamplers (Camag Linomat V), d’une chambre automatique de migration (ADC2, Camag) et un scanner UV-visible TLC (Camag Scanner 3)
Sélection d’article
- Genva M., Fougere L., Bahammou D., Mongrand S., Boutte Y. and Fouillen L. (2023). A global LC-MS2-based methodology to identify and quantify anionic phospholipids in plant samples. bioRxiv [link to the publication]
- Gan Sha, Peng Sun, Xiaojing Kong, Xinyu Han, Qiping Sun, Laetitia Fouillen, Juan Zhao, Yun Li, Lei Yang, Yin Wang, Qiuwen Gong, Yaru Zhou, Wenqing Zhou, Rashmi Jain, Jie Gao, Renliang Huang, Xiaoyang Chen, Lu Zheng, Wanying Zhang, Ziting Qin, Qi Zhou, Qingdong Zeng, Kabin Xie, Jiandi Xu, Tsan-Yu Chiu, Liang Guo, Jenny C. Mortimer, Yohann Boutté, Qiang Li, Zhensheng Kang, Pamela C. Ronald and Guotian Li (2023). Genome editing of a rice CDP-DAG synthase confers multipathogen resistance. Nature [link to the publication]
- M. B. F. Steentjes, A. L. Herrera Valderrama, L. Fouillen, D. Bahammou, T. Leisen, I. Albert, T. Nurnberger, M. Hahn, S. Mongrand, O. E. Scholten and J. A. L. van Kan (2022). Cytotoxic activity of Nep1-like proteins on monocots. New Phytologist [link to the publication]
- Mamode Cassim Adiilah, Navon Yotam, Gao Yu, Decossas Marion, Fouillen Laetitia, Grélard Axelle, Nagano Minoru, Lambert Olivier, Bahammou Delphine, van Delft Pierre, Maneta-Peyret Lilly, Simon-Plas Françoise, Heux Laurent, Jean Bruno, Fragneto Giovanna, Mortimer Jenny C., Deleu Magali, Lins Laurence and Mongrand Sébastien (2021). Biophysical analysis of the plant-specific GIPC sphingolipids reveals multiple modes of membrane regulation. The Journal of biological chemistry [link to the publication]
- Garot E., Dussert S., Domergue F., Joet T., Fock-Bastide I., Combes M. C. and Lashermes P. (2021). Multi-Approach Analysis Reveals Local Adaptation in a Widespread Forest Tree of Reunion Island.. Plant Cell Physiol [link to the publication]