Responsable: Pierre Pétriacq
La plate-forme Métabolome apporte un soutien à la recherche en biologie, en physiologie environnementale, en génomique fonctionnelle et en génétique dans le cadre de collaborations régionales, nationales et internationales. Elle est également utilisée pour l’analyse de produits dérivés de plantes et d’autres organismes
La plateforme permet:
- Quantification d’acides aminés par UHPLC-fluorimétrie
- Quantification des métabolites polaires majeurs par RMN-1H d’extraits polaires
- Réalisation et analyse d’empreintes métabolomiques par RMN-1H d’extraits polaires
- Réalisation de spectres RMN pour la mesure d’enrichissements isotopiques C13 sur des fractions, pour la mesure de flux métaboliques
Equipements Analytiques
- Un couplage LC-QqTOF-MS pour le profiling metabolique,
- Un couplage UHPLC-UHRMS LTQ-Orbitrap,
- Un couplage LC-Qtrap-MS,
- Un système UPLC pour la séparation et quantification des acides aminés (en phase inverse et avec une détection fluorimetrique)
Sélection d’articles
- Ghina Hajjar, Millena C. Barros Santos, Justine Bertrand-Michel, Cécile Canlet, Florence Castelli, Nicolas Creusot, Sylvain Dechaumet, Binta Diémé, Franck Giacomoni, Patrick Giraudeau, Yann Guitton, Etienne Thévenot, Marie Tremblay-Franco, Christophe Junot, Fabien Jourdan, François Fenaille, Blandine Comte, Pierre Pétriacq and Estelle Pujos-Guillot (2023). Scaling-up metabolomics: Current state and perspectives. TrAC Trends in Analytical Chemistry [link to the publication]
- Gan ShaGuillaume Decros, Thomas Dussarrat, Pierre Baldet, Cédric Cassan, Cécile Cabasson, Martine Dieuaide‐Noubhani, Alice Destailleur, Amélie Flandin, Sylvain Prigent, Kentaro Mori, Sophie Colombié, Joana Jorly, Yves Gibon, Bertrand Beauvoit and Pierre Pétriacq (2023). Enzyme‐based kinetic modelling of ASC–GSH cycle during tomato fruit development reveals the importance of reducing power and ROS availability. New Phytologist [link to the publication]
- Poucet T., Beauvoit B., Gonzalez-Moro M., Cabasson C., Pétriacq P., Flandin A., Gibon Y., Marino D. and Dieuaide-Noubhani M. (2022). Impaired cell growth in ammonium stress explained by modelling the energy cost of vacuole expansion in tomato leaves. The Plant Journal [link to the publication]
- Dussarrat T, Prigent S, Latorre C, Bernillon S, Flandin A, Díaz FP, Cassan C, Van Delft P, Jacob D, Varala K, Joubes J, Gibon Y, Rolin D, Gutiérrez RA and Pétriacq P. (2022). Predictive metabolomics of multiple Atacama plant species unveils a core set of generic metabolites for extreme climate resilience. New Phytologist [link to the publication]link to the publication]
- Nicolas Creusot, Betty Chaumet, Mélissa Eon, Nicolas Mazzella, Aurélie Moreira and Soizic Morin (2022). Metabolomics insight into the influence of environmental factors in responses of freshwater biofilms to the model herbicide diuron. Environmental Science and Pollution Research [link to the publication]